Sünnette uygulanan birkaç yöntem vardır. Sünnet işleminde temel amaç penis ucunu kapatan sünnet derisinin cerrahi olarak çıkarmaktır. Genellikle klasik yöntem tercih edilmelidir.
Halk arasında “ lazerle sünnet” denilen ama aslında lazer yerine elektrikle ısıtılmış telin kullanılan bir yöntemle sünnet yapılabilir. Isının yakıcı etkisine bağlı olarak damarlardan kanama olmaz. Fakat ısı aynı zamanda çevre dokuları etkileyebilir ve peniste hissizleşme görülebilir.
Bir diğer yöntem olan sünnet klempi kullanımında lokal anestezi ile dikişsiz, sargısız ve kanamasız sünnet yapılabilir. Klemp 2-4 gün içinde çıkartılır.
Teknolojiyle beraber sünnet için olumsuz bir gelişme oldu. Sünnette havya kullanılmaya başlandı. Halk arasında “lazerle sünnet “ denilen fakat hiç ilgisi olmayan bu sistemde elektrikle ısıtılmış telle deri kesilir. Isı etkisiyle damarlar yanar ve kanama görülmez. Fakat kanlanma ve duysal sinirler açısından hassas olan peniste havya kullanılması kalıcı hasar verebilir
